A cariotipagem é o processo de ordenação e emparelhamento de todos os cromossomos encontrados em um organismo, a fim de obter uma visão abrangente de todo o mapa cromossômico de um indivíduo.
Mas primeiro vamos nos certificar de que entendemos quais são os cromossomos em primeiro lugar. Os cromossomos são estruturas que parecem semelhantes aos fios que estão contidos no núcleo de cada uma das células do seu corpo.
Cada estrutura de cromossomo contém todo o plano de informações genéticas do seu corpo. Isto dita a maneira como o seu corpo está estruturado, reage aos estímulos, predisposição para doenças, etc. As mulheres têm dois cromossomos 'X' e os homens têm um cromossomo 'X' e um 'Y'. Cada célula do seu corpo contém 23 pares de cromossomos, 46 cromossomos no total.
Para que os pesquisadores possam entender as sequências dos cromossomos de cada paciente, eles usam o software de cariotipagem . Esse tipo de software é projetado para realizar análises de cromossomos e avalia a estrutura e o número de cromossomos de uma pessoa. Ao fazer isso, pesquisadores e cientistas podem detectar anormalidades.
Neste artigo, exploraremos algumas ótimas opções de software que permitem a análise de cariotipagem.
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ArgusSoft
ArgusSoft é uma ótima opção de software que permite que você automaticamente cariotípico cromossomos humanos por posição de banda, e também pode ser usado para cariotipagem de animais e cromossomos da planta on-line.
Características principais:
- Coloração em G, Q, R
- Cariotipagem automatizada de cromossomos humanos com reconhecimento de dobras
- Cariotipagem automatizada de cromossomos de porco
- 3 bases incorporadas de ideogramas padrão de cromossomos humanos com vários níveis de claridade - 400, 550 e 850 níveis
- Pode adicionar bases de ideogramas de cromossomas padrão para outras espécies animais e vegetais
- Métodos de preparação da amostra
- Entrada de imagens da placa metafásica usando uma câmera e um scanner
- Acompanhando uma imagem com gráficos
- Divisão automatizada de cromossomos aplicados e em contato
- Comparação de cromossomos e ideogramas
Você também pode usar ArgusSoft para treinar o sistema de reconhecimento de cromossomos usando preparações pré-definidas, pode transferir imagens de placa metafásica e cariogramas em banco de dados embutido, pode produzir padrões de relatórios, corrigir cariogramas e também armazenar e imprimir imagens e resultados de análise.
Você pode obter treinamento e suporte para usar o ArgusSoft em seu site oficial. O centro de suporte inclui serviços de treinamento, manutenção e consultoria.
Experimente o ArgusSoft
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HiBand pela Applied Spectral Imaging
O HiBand é um software criado pela Applied Spectral Imaging, que pode executar análises avançadas de cromossomos usando recursos de cariotipagem digital. Este software
usa recursos de varredura automatizada para uma análise detalhada da estrutura do cromossomo.
Você pode usar a ampla gama de recursos encontrados no HiBand para indexação, contagem, armazenamento e gerenciamento de dados de resultados. Você também pode usar este poderoso software para escanear a seqüência do cromossomo automaticamente.
Os resultados obtidos usando os recursos de cariotipagem encontrados no HiBand podem ser armazenados em um local seguro com camadas protegidas por senha e criptografadas. Isso permite que você tenha tranquilidade quanto a perder dados importantes de sequenciamento e, por isso, também melhora a eficiência do seu laboratório.
A classificação pelos resultados é feita de uma maneira muito fácil, basta pesquisar a sequência específica de cromossomos e todos os resultados são mostrados em uma tela bem contida que oferece fácil acesso para modificar, revisar e também adicionar tags a qualquer dos arquivos.
Características principais:
- Karyotyping-G-Faixa e R-Banda de Campo Brilhante
- Fluorescência Cariotipagem-Q-Band, R-Band e FISH
- Cariotipagem Espectral
- Contagem cromossômica automática
- Indexação e classificação cromossômica
- Separação avançada de cromossomos e aprimoramento avançado de imagem
- Galeria de imagens - pode apresentar todas as metáforas e cariótipos em uma única tela
- Pode comparar cromossomos - vê-los lado a lado
- Ideograma Abberante - você pode adicionar cromossomos, células, ideogramas e anotações em um gerador de imagens
O HiBand utiliza fluxos de trabalho totalmente automatizados para aumentar a eficiência do laboratório, possui recursos de escaneamento, encontra metáfases, lê códigos de barras automaticamente, carrega imagens em tempo real durante escaneamento e também exporta para o Portal Central do LIS e Base de dados.
Tente HiBand
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Ikaros por MetaSystems
Este sistema de cariotipagem possui uma interface de usuário bastante intuitiva que oferece todos os recursos em uma única tela. Isso permite acesso fácil e rápido a todas as informações obtidas.
O Ikaros pode ser usado com o Neon, que é uma plataforma projetada para ajudar com dados de imagem e organização de casos. O Neon coleta dados de todos os trabalhos de criação de imagens, fontes externas e permite apresentá-los de maneira fácil de entender usando um painel de gerenciamento de casos.
Essa ferramenta permite que você tenha sempre informações importantes à mão e armazenadas de maneira segura, mas usa algoritmos de gerenciamento de dados muito fortes, tem uma boa variedade de maneiras de observar dados e pode fornecer pesquisas específicas com base em palavras-chave e características de dados.
Confira mais informações sobre o Neon e seus recursos aqui .
Ikaros suporta muitas técnicas de bandas diferentes - Brightfield G-Band e R-Band, Fluorescência Q-Band, R-Band e FISH -, oferece um grande número de formas pré-definidas de cariograma para humanos, plantas e animais. Você pode editar facilmente esses formulários para adicionar os dados necessários para o tipo de pesquisa que está fazendo.
O fato de você poder comparar os cromossomos por clas- ses ou por cariogramas oferece informações muito úteis que permitem identificar facilmente as diferenças.
Tente Ikaros
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MetaClass por Microptic
O MetaClass é um ótimo software de cariotipagem desenvolvido de maneira modular. Este software ajuda você a realizar estudos de cariotipagem e FISH de cromossomos.
O MetaClass é formado pelos seguintes módulos:
- Banco de dados MetaClass
Banco de dados que pode ser instalado com qualquer um dos módulos do MetaClass. Permite que você armazene detalhes do paciente e oferece acesso fácil aos resultados. Você pode criar relatórios personalizados em qualquer idioma com este módulo.
- Cariotipagem MetaClass
Permite estudar um cariótipo após as imagens do estágio de preparação da metáfase terem sido capturadas digitalmente e organizá-las em pares com base no tamanho, posição, etc. Este módulo oferece excelentes resultados de qualidade quando se trata de bandas cromossômicas e também fornecer relatórios com aparência profissional.
Os principais recursos incluem:
- O estudo do cariótipo é analisado sob ampliação de campo claro de 100X
- Pode capturar várias imagens do Metaphase
- A qualidade da imagem é modificável para resultados mais nítidos
- Classificação automática de cromossomos
- 4 visualizações de tela - janela de cromossomos Metáfase, Cariótipo e Não Classificados
- Pode exibir protótipos de cromossomos
- Os cromossomos que não são classificados podem ser corrigidos automática ou manualmente - sobreposições, separação, cruzamentos, rotações etc.
- Arquivos de sessão MTC ou imagens BMP podem ser salvos e recarregados a qualquer momento
- Pode exportar cromossomos individuais para o Metaclass Database com a possibilidade de adicionar comentários e anotações
Aqui está um exemplo de um relatório de cariotipagem metaclasse.
- MetaClass FISH
Este é um módulo de análise que permite obter a imagem Fluorescent IN SITU Hybridization (FISH). Este módulo captura imagens usando sondas de DNA fluorescentes e permite confirmar anormalidades genéticas - trissomias, mocrodelections, rearranjos cromossômicos, etc.
As imagens FISH são analisadas com ampliação de 100X e, para uma maior gama de clareza de imagem, também podem capturar imagens com filtros diferentes.
Se você estiver interessado em obter mais informações sobre os módulos apresentados acima e outros recursos, você pode dar uma olhada no catálogo MetaClass.
Se você é um tipo curioso e quer ver um relatório obtido usando o método FISH, você pode
um arquivo PDF de amostra.Experimente o MetaClass
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GenASis Bandview
GenASis Bandview é outro grande software de cariotipagem que é construído a partir de módulos com diferentes capabitilites. Você pode usar este aplicativo para realizar diagnósticos de cariotipagem e obter resultados de testes precisos.
Este software permite personalizar totalmente o fluxo de trabalho e o processo de diagnóstico, dependendo das necessidades da sua empresa e das metas que você está tentando alcançar.
A ampla gama de ferramentas fornecidas no BandView é facilmente acessível com apenas um clique do mouse e oferece poderosa experiência de cariotipagem G / R / C / Q-Band. Você pode escolher entre um fluxo de trabalho automatizado ou manual quando se trata de localizar metáfases e capturar imagens.
Anormalidades cromossômicas, se encontradas, podem ser observadas através da adição, deleção ou rearranjo do material genético do paciente. Com o BandView, você pode usar a técnica molecular da banda de FISH.
FISH utiliza sondas fluorescentes para se ligar a diferentes partes do cromossoma, permitindo ao software detectar e localizar as anormalidades encontradas em sequências de DNA específicas.
Tente GenASis Bandview
Conclusão
Neste artigo, exploramos alguns dos melhores softwares de cariotipagem automatizados que existem no mercado no final de 2018.
As opções de software de cariotipagem abordadas neste artigo oferecem uma variedade de recursos que ajudarão você a atingir as metas da sua empresa.
Usando este tipo de software, você pode contar rapidamente milhares de estruturas de cromossomos, analisar com diferentes técnicas profissionais e produzir relatórios de alto nível que lhe permitirão identificar qualquer anormalidade com facilidade.
Nós gostaríamos de descobrir qual é a sua opinião sobre o software que apresentamos nesta lista dos 5 melhores. Por favor, sinta-se livre para nos avisar usando a seção de comentários abaixo.
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